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生物信息学
澳大利亚
bioinformatics欧洲或澳洲的phd program申请者一般背景如何?哪些机构实力比较雄厚?
如题,希望在读的或者毕业的提供下关于对申请者背景要求的信息,生物学方向的学生(国内硕或本)自学python和R后竞争力和CS或者math背景的学生相比如何?在欧洲和澳洲哪些机构的bioinformatics研究实力较雄厚(发表文章和经费)?
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匿名用户
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不一定要走bioinfomatics,System biology可能更好一些。说实话和数学计算机的竞争力没法比,但是我们的长处又不在这一方面。他们会写程序,我们会构思程序,我们会用数据,会从数据发现结果,这才是我们的优势。对澳洲欧洲不太了解,不建议纯去生物信息学的实验室,现在做以前分子啊之类大老板的实验室都在招相关人才,可以去试试。
匿名用户
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看运气……
特别是,学CS和math的娃大多对生物没兴趣,所以这块还得招能做CS的生物娃。
bioinformatic 的面并不宽,如果我没理解错主要还是集中于数据挖掘。
system biology 的招牌很大,做什么的都自称是做系统生物学的,但是其实行内人知道,现在谁做的都不是真正的系统生物学。
比较具体的方向还有:
分子模拟/药物设计,用各种计算化学的软件。
生物物理,这货也是个筐,说不明白自己做什么的就说自己是做生物物理的。这块上到搭显微镜、玩软X射线,下到折腾蛋白,离子通道……生物力学,生物矿化,想扔这个筐都没啥问题。
现在所谓“交叉学科”比较多,就是说,这个实验室可能有做有机的,无机的,计算的,就缺一个做PCR的;可能有做杂交的,纯化的,就缺一个建库的;可能一个部门的人都是做计算的,只有一个组做实验,看看这群家伙计算的靠谱不靠谱……可能性真的很多,你永远不知道会有怎样的职位等着你。
第二个问题,只说德国我知道的机构。
马普系列,你最好把几十个所,名字稍稍相关一点的,都点开来看看大方向。不要因为名字看着奇怪就放过去。
比如我们所叫做胶体与界面所,五个部,理论部一群算分子马达和基因组进化的,生物材料部一群做生物力学的,生物分子部反而是一群做有机合成的。
我们隔壁的植物分子所,一群做代谢途径的,还有建数据库的。
德雷斯顿的计算生物所估计你会重点看,可是另一个分子生物所(如果我没记错名字的话),我知道有个师兄跑去做计算了。
哥廷根有生物物理所和“动态系统所”,其实两边做的东西重叠很多……
以上是我申请时候关注过的。
此外海德堡还有个癌症中心。我一个师姐应该是去那里了。
加油。
付蓬芃
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不需要和数学背景的比吧,因为一个生信实验室既有生物背景又有计算机背景,甚至数学、物理背景的人,有个生信老板是物理出身就很喜欢招来的物理出身的博后。
就我自己觉得生物背景的学python、perl都比较容易(仅限于生信所需要掌握的程度),计算机数学背景的要对生物学有一个系统的理解相对来说比较难。
反正别管什么出身,加强自己的能力优势就会增加一点。另外还要看申请的老板看重什么,我自己是计算机基本小白,生化也不及格,面试时居然因为英语好被老板看中了......让我对这个世界的不确定性又加深了认识......
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特别是,学CS和math的娃大多对生物没兴趣,所以这块还得招能做CS的生物娃。
bioinformatic 的面并不宽,如果我没理解错主要还是集中于数据挖掘。
system biology 的招牌很大,做什么的都自称是做系统生物学的,但是其实行内人知道,现在谁做的都不是真正的系统生物学。
比较具体的方向还有:
分子模拟/药物设计,用各种计算化学的软件。
生物物理,这货也是个筐,说不明白自己做什么的就说自己是做生物物理的。这块上到搭显微镜、玩软X射线,下到折腾蛋白,离子通道……生物力学,生物矿化,想扔这个筐都没啥问题。
现在所谓“交叉学科”比较多,就是说,这个实验室可能有做有机的,无机的,计算的,就缺一个做PCR的;可能有做杂交的,纯化的,就缺一个建库的;可能一个部门的人都是做计算的,只有一个组做实验,看看这群家伙计算的靠谱不靠谱……可能性真的很多,你永远不知道会有怎样的职位等着你。
第二个问题,只说德国我知道的机构。
马普系列,你最好把几十个所,名字稍稍相关一点的,都点开来看看大方向。不要因为名字看着奇怪就放过去。
比如我们所叫做胶体与界面所,五个部,理论部一群算分子马达和基因组进化的,生物材料部一群做生物力学的,生物分子部反而是一群做有机合成的。
我们隔壁的植物分子所,一群做代谢途径的,还有建数据库的。
德雷斯顿的计算生物所估计你会重点看,可是另一个分子生物所(如果我没记错名字的话),我知道有个师兄跑去做计算了。
哥廷根有生物物理所和“动态系统所”,其实两边做的东西重叠很多……
以上是我申请时候关注过的。
此外海德堡还有个癌症中心。我一个师姐应该是去那里了。
加油。
付蓬芃
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就我自己觉得生物背景的学python、perl都比较容易(仅限于生信所需要掌握的程度),计算机数学背景的要对生物学有一个系统的理解相对来说比较难。
反正别管什么出身,加强自己的能力优势就会增加一点。另外还要看申请的老板看重什么,我自己是计算机基本小白,生化也不及格,面试时居然因为英语好被老板看中了......让我对这个世界的不确定性又加深了认识......